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Construisant l’Union européenne à son échelle, la Région s’inscrit dans plusieurs espaces et programmes de coopération territoriale européenne qui favorisent les dynamiques interrégionales.

Afin de défendre ses intérêts, la Nouvelle-Aquitaine s’est notamment associée aux autres Régions littorales pour définir une stratégie maritime atlantique, afin de stimuler « l’économie bleue », qui pourrait permettre de créer 7 millions d’emplois en Europe d’ici 2020.

Elle collabore également sur l’espace pyrénéen en participant activement à la Communauté de travail des Pyrénées qui gère le programme de coopération transfrontalière Espagne-France-Andorre (Poctefa), doté de 180 millions d'euros de fonds européens.

Elle s’implique également dans 3 autres programmes de coopération territoriale européenne sur 3 grands espaces :

• Le programme Espace Atlantique regroupant les régions de la façade atlantique, depuis le Portugal jusqu’au nord de la Grande-Bretagne, doté de 132 millions d'euros

• Le programme SUDOE (Sud-ouest européen) regroupant toutes les régions de la péninsule ibérique et le Sud-Ouest de la France, doté de 100 millions d'euros

• Le programme Interreg Europe couvrant l’ensemble du territoire européen doté de 576 millions d'euros.